1、缴纳险种不同：职工社保缴纳五险：基本养老保险、基本医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险；灵活就业社保缴纳两险：基本养老保险和基本医疗保险，北京、南京和哈尔滨地区还可以缴纳失业保险。
2、社保待遇差异：职工社保含生育保险，职工生育后可以享受生育费用报销，有生育津贴等。而灵活就业社保不含生育保险，生育的无法享受生育报销等待遇。
3、退休年龄不同。女性参加灵活就业的退休年龄统一为 55 周岁，而职工社保退休年龄根据身份决定，女工人 50 周岁，女干部 55 周岁。男性不论参加灵活就业社保还是职工社保退休年龄统一为 60 周岁。延迟退休政策出台后，再结合看。
4、法定义务不同
灵活就业社保：灵活就业是个人实现就业的一种形式，属于非标准就业方式。当下非常火热的灵活用工是相对的概念。就业职工社保：在单位就业签订劳动合同是我国的基本就业形式，也是标准就业方式。
5、缴费基数与比例不同
职工社保五险由所在企业与职工共同缴纳，缴费基数来源于本人工资。养老保险企业按照 16%（个别城市低于 16%），个人承担 8%，医疗保险企业与个人缴纳比例因城市不同比例不同，个人费用由企业从本人工资中扣除并代扣代缴。个人缴纳的养老保险 8% 划入个人账户，医保个人账户按照年龄和比例划入。
灵活就业社保参加养老保险或医疗保险是自愿缴纳的，在户籍所在地的公共人才服务机构办理。养老保险缴费基数可在当地社平的 60%-300% 之间自行选择，养老保险按照统一 20% 的比例缴纳费用，医疗一般按照固定基数和比例缴纳，全部由个人承担，其中缴纳养老保险的 8% 划入个人账户，医疗保险按照年龄和比例划入个人医保账户。
